در روز پانزدهم آبان‌ماه ۱۳۹۸، اطلاعیه‌ای از سوی دبیرخانه‌ی شورای گذار بر روی تارنمای آن گذاشته شد که خبر از کناره‌گیری یکی از مشاوران را می‌داد. این خبر نزدیک به ده روز پس از اعلام کناره‌گیری آن مشاور از سوی خودش، از سوی دبیرخانه‌ی شورا رسانه‌ای شد. خبرگاه از اینکه آیا این به خاطر طی روند سازمانی پذیرش کناره‌گیری بوده یا دلایل دیگر، اطلاعی ندارد.
گمان می‌رود این مشاور که چه در جریان برپایی شورا، و چه پس از آن به خاطر دیدگاه‌های جنجالی قوم‌مدارانه و جنگ‌طلبانه، نام‌آور و شناخته‌شده گردیده بود، به خاطر هزینه‌هایی که به شورا وارد کرده است با ناسازگاری و مخالفت‌هایی در شورا روبه‌رو شده تا جایی که کناره‌گیری نموده است. هرچند متن اطلاعیه دبیرخانه شورای گذار دلیل کناره‌گیری را «همسان نبودن دیدگاه‌های بین‌المللی» نگاشته است.
در روز یکم آبان نیز یکی دیگر از قوم‌مداران شورای گذار کناره‌گیری نموده بود. این را شاید بتوان توانمند شدن بخش ملی‌گرای شورای مدیریت گذار در راستای دموکراسی برای همه‌ی مردم ایران دانست که اگر این چنین باشد می‌تواند آینده‌ی خوبی را به دست دهد.
خبرگاه
خبرگزاری حزب سکولار دموکرات ایرانیان